Hüseyin Aygün, 20 Ekim 1970 tarihinde Tunceli'de dünyaya geldi. Ankara Üniversitesi Hukuk Fakültesi'ni tamamladıktan sonra serbest avukatlık yaparak meslek hayatına başladı. Zaza kökenli olan Aygün, aynı zamanda bir yazar olarak da tanınmaktadır. Üç kitabı bulunan Aygün'ün, bunlardan biri Zazaca’dır.
2011 yılında yapılan genel seçimlerde Cumhuriyet Halk Partisi’nden Tunceli milletvekili olarak Türkiye Büyük Millet Meclisi'ne (TBMM) seçilen Aygün, XXIV. dönemde İnsan Haklarını İnceleme Komisyonu’nda da görev almıştır. Evli ve iki çocuk babası olan Aygün, siyaset yaşamında özellikle insan hakları ve özgürlükler konusunda önemli çalışmalara imza atmıştır.
Aygün, Tunceli’deki seçim kampanyasında PKK terörüne karşı eleştirilerde bulunmuş ve PKK'ya yönelik eleştirel bir yaklaşım sergilemiştir. Bu açıklamalarının ardından, 12 Ağustos 2012 tarihinde iki PKK’lı militan tarafından kaçırılmış, iki gün süren bir alıkonulma sürecinin ardından serbest bırakılmıştır. Aygün, bu olayla ilgili olarak yaptığı açıklamalarda, terörün ve şiddetin her türlüsüne karşı olduğunu vurgulamıştır.