1968 yılında Nevşehir’de dünyaya gelen Mustafa Çalışkan, eğitim hayatına Kayseri’de başlamış ve 1987 yılında Polis Akademisi’nden mezun olmuştur. 1991’de İstanbul Emniyet Müdürlüğü’nde Komiser Yardımcısı olarak göreve başlayan Çalışkan, pek çok şehirde önemli görevlerde bulunmuş ve mesleki deneyimini arttırmıştır. Özellikle İstanbul’daki kritik görevleriyle tanınan Çalışkan, Çevik Kuvvet, İstihbarat ve Terörle Mücadele gibi önemli birimlerde görev almıştır.
Yalova, Batman, Sakarya ve Adana illerindeki görevlerinde de başarılarıyla öne çıkan Çalışkan, aynı zamanda uluslararası alanda da deneyim kazanmış ve Birleşmiş Milletler Polis Barış Gücü’nde görev yapmıştır.
Eğitimine de büyük önem veren Çalışkan, yüksek lisans ve doktora eğitimlerini tamamlamış, güvenlik alanındaki bilgi birikimini akademik olarak da derinleştirmiştir. 2015 yılında İstanbul Emniyet Müdürü olarak göreve başlayan Çalışkan, suç oranlarını düşürmek ve güvenlik stratejilerini güçlendirmek için önemli projelere imza atmıştır.
2024 yılında İstanbul Emniyet Müdürlüğü görevini tamamlayan Çalışkan, Emniyet Genel Müdür Yardımcılığına atanarak kariyerinde yeni bir döneme adım atmıştır.